Thành lập năm 1976, Xí nghiệp Dược Phẩm 2/9 tiền thân của Công Ty Cổ Phần Dược Phẩm 2/9 ngày nay là đơn vị kinh tế cơ sở có tư cách pháp nhân và hạch toán kinh tế độc lập trên cơ sở sát nhập 07 Viện Bào Chế tư nhân. Ngày 2/8/1977, Ủy Ban Nhân Dân Tp.HCM ra quyết định số 437/QĐUB công nhận Xí nghiệp Dược Phẩm 2/9 thuộc Sở Y Tế Tp.HCM. Căn cứ vào quy chế thành lập và giải thể doanh nghiệp nhà nước ban hành theo nghị định 388/HĐBT ngày 20/11/1991 và Nghị định 156/HĐBT ngày 7/5/1992 về việc sửa đổi bổ sung nghị định 388, XNDP 2/9 tiến hành đăng ký thành lập Doanh Nghiệp Nhà Nước và ngày 23/3/1993 chính thức được Ủy Ban Nhân Dân Thành Phố ký quyết định thành lập doanh nghiệp. Nhằm tiếp tục thực hiện chính sách kinh tế nhiều thành phần theo định hướng XHCN, tạo mọi điều kiện để doanh nghiệp và người lao động đầu tư và phát triển doanh nghiệp trong việc đa dạng hóa các hình thức sở hữu, XNDP 2/9 thực hiện tiến trình cổ phần hóa để nâng cao hiệu quả sản xuất kinh doanh của doanh nghiệp và tạo điều kiện để người lao động thực sự làm chủ doanh nghiệp. Ngày 15/6/2001 Thủ Tướng chính phủ ký Quyết định số 736/QĐ-TTg chuyển Xí Nghiệp Dược Phẩm 2/9 thành Công Ty Cổ Phần Dược Phẩm 2/9.